生物信息学平台-清华大学基础医学院

科研平台

生物信息学平台

2024-04-25

主管:蓝勋

生物信息学平台是数字医学平台发展的重要基石。平台摒弃了传统服务器简单堆叠方式,采用容器云架构,将硬件资源整合到统一的平台集中管理与分配。使用者可根据需求申请cpu及内存资源构建工程项目,并从Harbor库打包下载已安装了所需软件的镜像,直接上手进行生物信息学研究工作。同时,可实时将研究成果上传集群内建git库保存。也可进行机器学习模型的调试与开发,同时容纳多项目的高效运行。

目前维护的linux,Rstudio,Jupyter三大公共镜像,随着人员和算力需求的扩大,机房未来几年需要逐渐扩展至10~14个机架,具备更大的计算和存储能力。由于生信分析需求复杂,软件升级迭代速度快等特点,生信系统将不断完善,从各方争取资源,获得源源不断的投入和支持。

计算平台本年度运行平稳,共开通25个实验室,创建210个账号,保障同学们的科研使用需求。感谢万科基金支持,本年度扩容存储1.5P,暂时缓解存储空间紧张。增添安装及升级生信软件30余款。逐步添加了数据备份,公共数据整理,私有镜像等功能。达到预期目标和考核指标。

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