教育背景
2011年-2015年 阿尔伯塔大学 博士
2006年-2011年 西北农林科技大学 学士
工作经历
2016年-2021年 美国宾夕法尼亚大学 博士后
2021年-2024年 清华大学医学院 助理教授
2024年-至今 清华大学基础医学院 助理教授
研究领域
病毒在全球环境中拥有最多的，大约10^ 31的个体数。病毒组一般指某种特定环境下所有病毒的集合，是微生物组的重要组成部分。病毒组主要包括能够感染真核细胞的病毒和感染细菌的噬菌体。人类对于能够引起人类或动物疾病的病毒已经进行了数十年的研究，而对于病毒群体整体研究一直不够深入。近年来随着相关技术的发展，越来越多的证据显示人类病毒组拥有巨大的多样性和异质性，并且与人类健康息息相关，成为了潜在的致病原因或治疗靶标。
课题组将利用各种生物医学技术，尤其是多组学和生物信息学技术，通过对人类生物样品，模式动物和各种体外实验的分析，深入研究人类病毒组与宿主的关系，并探索其对人类健康的影响。
我们关注病毒组在健康人体的建立与发展过程。我们前期的研究发现了病毒组在人体内的分段定植模式。健康的人类新生儿通常在出生时没有病毒，但出生后很快就被细菌寄生。最初阶段定植的病毒主要由最初寄生在肠道的细菌基因组内的原噬菌体诱导释放而产生。下一阶段的定植涉及到动物病毒在肠道的寄生，而这一过程中对于噬菌体和动物病毒的定植影响最大的因素是母乳喂养。
我们同样重视病毒组在相关疾病中的作用机制。例如，我们发现炎症性肠病病人肠道内含量最为丰富的两种噬菌体，Caudovirales和Microviridae之间比例与疾病严重程度密切相关，相关的噬菌体可能通过与细菌和宿主三方相互作用促进疾病病症。另外一项研究中，通过对新冠病人呼吸道病毒组的分析，发现了可预测疾病严重程度的共生病毒。
科学贡献
1. 2023年9月：中国医疗保健国际医疗促进会临床微生物学分会常委
2. 2023年10月：中国生物工程学会噬菌体技术专委会委员
3. 2024年11月 中国微生物学会智能计算微生物学专业委员会委员
荣誉奖励
2014年7月：阿尔伯塔创新奖
代表性论文
1. Gao H, Wang Y, Zhao Y, Jiao X, Guo Z, Zheng L, Li Y, Su Y, Wang Z, Bai J, Yao J, Bushman FD, Luo S, Song X, Liang G.Human gut prophage landscape identifies a prophage-mediated fucosylation mechanism alleviating colitis.Nat Commun. 2025 Nov 22. doi: 10.1038/s41467-025-66733-5.
2．Liu D, Hu J, Zhang D, Ren S, Zhao L, Gao H, Hu S, Xu S, Liang G.Use of the CHM13-T2T genome improves metagenomic analysis by minimizing host DNA contamination.mSystems. 2025 Oct 22;10(10):e0084025. doi: 10.1128/msystems.00840-25. Epub 2025 Sep 10.
3．Xu T, Jiao X, Liu G, Chen X, Luo Q, Zhang G, Li B, Zhang Y, Li X, Cheung Y, Chai X, Huang Y, Wu H, Deng F, Chen F, Liang G.Oral virome metagenomic catalog links Porphyromonas gingivalis phages to obesity and type 2 diabetes.Cell Rep Med. 2025 Sep 16;6(9):102325. doi: 10.1016/j.xcrm.2025.102325. Epub 2025 Sep 1.
4．Gao H, Li B, Guo Z, Zheng L, Chen J, Liang G. Highly accurate prophage island detection with PIDE.
Genome Biol. 2025 Aug 20;26(1):254. doi: 10.1186/s13059-025-03733-0.
5．Yang T, Hu X, Cao F, Yun F, Jia K, Zhang M, Kong G, Nie B, Liu Y, Zhang H, Li X, Gao H, Shi J, Liang G, Hu G, Kasper DL, Song X, Qian Y. Targeting symbionts by apolipoprotein L proteins modulates gut immunity. Nature. 2025 Jul;643(8070):210-218. doi: 10.1038/s41586-025-08990-4. Epub 2025 May 14.
6．Luo Q, Gao H, Xiang Y, Li J, Dong L, Wang X, Liu F, Guo Y, Shen C, Ding Q, Qin C, Liang G, Wen L.
The dynamics of microbiome and virome in migratory birds of southwest China.
NPJ Biofilms Microbiomes. 2025 Apr 23;11(1):64. doi: 10.1038/s41522-025-00703-z.
7．Ma S, Yin Y, Guo Y, Yao C, Xu S, Luo Q, Yin G, Wang S, Wang Q, Chen H, Wang R, Jin L, Liang G, Wang H. The plasma viral communities associate with clinical profiles in a large-scale haematological patients cohort. Microbiome. 2024 Jul 23;12(1):137. doi: 10.1186/s40168-024-01855-4.
8．Qiu X, Liang G, Zhou W, Sen R, Atchison ML. Multiple lineage-specific epigenetic landscapes at the antigen receptor loci. Aging Res. 2023 Sep;1(1):9340010. doi: 10.26599/agr.2023.9340010. Epub 2023 Aug 24.
9．Wang H, Xu S, Li S, Su B, Sherrill-Mix S, Liang G. Virome in immunodeficiency: what we know currently. Chin Med J (Engl). 2023 Nov 20;136(22):2647-2657. doi: 10.1097/CM9.0000000000002899. Epub 2023 Nov 1.
10．Guan Y, Zheng L, Liang G. The Viral Version of Enterotypes.
J Crohns Colitis. 2023 Oct 20;17(9):1371-1372. doi: 10.1093/ecco-jcc/jjad102.
11．Guan Y, Gao H, Leu NA, Vourekas A, Alexiou P, Maragkakis M, Kang Z, Mourelatos Z, Liang G, Wang PJ. The MOV10 RNA helicase is a dosage-dependent host restriction factor for LINE1 retrotransposition in mice. PLoS Genet. 2023 May 1;19(5):e1010566. doi: 10.1371/journal.pgen.1010566. eCollection 2023 May.
12．Merenstein C, Liang G, Whiteside SA, Cobián-Güemes AG, Merlino MS, Taylor LJ, Glascock A, Bittinger K, Tanes C, Graham-Wooten J, Khatib LA, Fitzgerald AS, Reddy S, Baxter AE, Giles JR, Oldridge DA, Meyer NJ, Wherry EJ, McGinniss JE, Bushman FD, Collman RG. Correction for Merenstein et al., "Signatures of COVID-19 Severity and Immune Response in the Respiratory Tract Microbiome". mBio. 2022 Oct 26;13(5):e0229322. doi: 10.1128/mbio.02293-22. Epub 2022 Aug 31.
13．Liang G, Gao H, Bushman FD. The pediatric virome in health and disease. Cell Host Microbe. 2022 May 11;30(5):639-649. doi: 10.1016/j.chom.2022.04.006.
